Dünya çapındaki büyük felaketten 9 yıl sonra…

Yeni dünyanın hegemonyası çerçevesinde güç sahiplerinin durmak bilmez mücadelesinin ortasında, bedenini yeniden yapılandırabilen genç bir adam olan Naoki, mekanik hayvanı “Kamui”ye binen genç bir kızla karşılaşır.

Dünyanın kurtarıcısı olacağı söylenen Hinako adındaki bu kızı korumaya çalışan Naoki ve arkadaşları, anakara bağlantılı solucan şeklindeki devasa bir mekanik hayvan ve Mars’tan gelen karga şeklindeki mekanik hayvanların amansız saldırısına uğrar!..